ImageJ免疫荧光量化及共定位分析（4：30以后）

东尼大大目:
最近正在发愁免疫荧光定量，看了你的视频果断关注，b站好多up主的方法都看过，对免疫荧光量化还是很糊涂，可能是组织做的IF所以对细胞的例子不是很能理解，我用你的方法取三个框目的蛋白的荧光值，prism作图横坐标是分组，但是纵坐标值应该怎么算就不懂了，有的视频写的MOD值，可是我每组只有一张片子，能不能劳烦up主给录一期适合我这种小白看的比较系统全面的处理视频，谢谢您

【回复】谢谢你的关注。组织跟细胞是差不多的，如果你每组只有一张，可以随机选取3个视野拍摄。纵坐标的话可以我一般会写 XXX intensity (a.u.)。不知道有没有解答你的疑惑。
【回复】回复 @东尼大大目 :方框所选的mean值就是柱状图中纵坐标的intensity值，已经是除过框面积的的平均值了，不需要再除了。
【回复】回复 @Chaney爱科研爱相声 : 感谢回复，我就是想咨询一下，您在本期视频中方框所选的mean值就是柱状图中纵坐标的intensity值吗？还是要除面积？如果除面积的话是图的总面积还是框的面积？
Serotonin旺财:
up，我按第二个方法做了荧光的共定位分析，为什么做出来的图是全黑的

【回复】同样问题找到一个解决办法：分析的时候选择clocalization 下的clocalization treshold 进行分析你先可以出来图片，再结合coloc 2分析得到皮尔逊值
【回复】me too, 只有一条白线，其余都是黑的
【回复】朋友们我重装了软件就好了
一只咸鱼大大:
up主，我想请问文献中经常出现的那种组织切片中百分之多少的细胞共标是怎么统计出来的

【回复】蹲个大佬回复[大哭][大哭][大哭]
【回复】您好，想请问一下您解决这个问题了吗？可以分享一下吗？
七粒糖果吖:
求助up主，最后生成pdf里的Manders系数有Mander’s M1、Mander’s M2、Mander’s tM1、Mander’s tM2 应该选哪个呢？

【回复】这个视频里有讲BV18i4y1g7kC
臧忆农的麻麻:
可以解决白线问题 链接：https://pan.baidu.com/s/1XIqLh_Hsk7kucLkRRbJrxw 提取码：pg74 --来自百度网盘超级会员V7的分享

【回复】用了你这个也还是白线啊
sky玉生烟:
只有一条白线，其他全黑背景的朋友: 是因为fiji 版本不对，这个可以 现在最常用的imageJ软件FIJI的安装包 链接：pan.baidu.com/s/1OqQTpd 提取码：eq67

【回复】请问还可以再分享一下吗[大哭]
【回复】请问可以再分享下吗？链接失效了
你是猪吗_-_:
最后生成pdf里的皮尔逊系数有三个（no threshold）（below threshold）（above threshold），应该选哪个呢

【回复】建议选Pearson's R value (no threshold) ，因为我前面没有调节过threshold，所以选了这个。如果你也跟我做的一样的话，可以选no threshold
【回复】回复 @Chaney爱科研爱相声 :那什么情况下应该选above那个呢，是调过threshold的情况下吗
人多的地方我不去:
这是用激光共聚焦拍的还是倒置荧光显微镜拍的

【回复】回复 @フランスのモリ一 :共聚焦扫层，倒置看所有，共聚焦更好
【回复】这是我找的文章里的图片，应该是共聚焦拍的。
【回复】我其实搞不懂这两个的区别
我也不想摸鱼啊:
阿婆主，共定位的第二个方法我的软件没有那个选项，是版本不对吗？蹲一下up主用的，感谢感谢

【回复】我用的Fiji，私信我发给你
【回复】回复 @向日葵2440 :闪退可能是因为fiji所在路径文件夹有中文命名的 换到全英文的路径就不会闪退了
【回复】回复 @Chaney爱科研爱相声 :同求 我装了以后fiji闪退
黑水泛波的湖心冰灯:
你好，我看到你的Image J里分析共定位使用的插件是coloc2，我最近没有安装成功，请问可以请教您一下如何安装的吗

【回复】Fiji的插件比较全，我用的是Fiji
开开心心快快乐乐111111:
您好，请问散点图直接用做定量出图可以不，我怎么找不到文献[大哭]

虎背熊腰霹雳虎:
20um是自己设的吗？还是说图片上的标尺

不会开花的华:
Up我从tools下面那些选项都没有，为啥呀[大哭]

不会开花的华:
up共定位用第一个能算共定位系数嘛？[大哭]

西瓜学长:
大佬，我想请问有办法分析组织脑片的膜蛋白吗

葫芦娃3救爷爷:
我點了共定位OK之後 沒有反應了？？請問是什麽情況呢？

卡夫卡的小能:
请问有没有小伙伴知道，用第一种方法分析的共定位情况，点保存之后只有一列荧光值，没有前面的横坐标，这种情况怎么解决呀？[保佑]

潜潜的潜:
有没有人救救我啊！我导出来只有y轴怎么办啊

bili_64919736027:
请问大家，怎么将共聚焦的照片转为bit格式啊

bili_12430189160:
您好，我想问下免疫荧光定量的时候，我的是同一个框，为什么面积不一样？