R 语言 |Python |生物信息学 | 医学生| SCI | 30岁 | 必坑~

作者: 生信猫_阿城学长分类: 科学科普 发布时间: 2022-07-21 23:58:06 浏览:54065 次

R 语言 |Python |生物信息学 | 医学生| SCI | 30岁 | 必坑~

潺梨:
我看封面想了半天:“自 学生 信”是什么意思[笑哭]

【回复】我是直接看成自信学生,还想up主真是自信[妙啊]
【回复】我还以为是“致学生信”
爱吃肉的李小黑:
[doge]做好下游就够了,上游代码固定 但是需要很好的硬件支持

【回复】老弟有经验啊,我最近加入了上游公司,有机会给你们分享[doge]
【回复】回复 @喜欢羽毛球的医学生 :到了[脱单doge][脱单doge][脱单doge]
【回复】要什么配置以上的硬件[害羞]
阴虚小白:
我先学了机器学习,后学的生信,坑跳着踩哈哈

【回复】我现在就在自学机器学习,,我是想自学生信的但是光Linux入门都要起码两个礼拜,倒是机器学习快多了[辣眼睛]
【回复】回复 @-滂沱 :这些想要应用都不难,但弄清原理融会贯通不易,我学着感觉不明白的点都是数学功底不够,现在倒回去学数学了
【回复】回复 @阴虚小白 :数学真是噩梦[灵魂出窍]加油兄弟!
小字若安:
老师让我们学下机数据处理,说是公司太慢,让我们自己处理原始数据[tv_doge]

【回复】回复 @寻觅大于等待 :有,这个点回复也是可以的了[笑哭]
【回复】回复 @寻觅大于等待 :hhh,真的吗,谢谢吖[星星眼]
芋泥芒果波波冰:
路过的好心人来帮帮我,我本科是中药专业。现在读研课题选的是肺动脉高压这方面,昨天老师和我开会说想让我查查生物信息分析。如果感兴趣的话想让我学这个,可以看了一圈发现和我之前所学专业毫不相干[笑哭]有没有人可以说一下他的利与弊啊?

【回复】回复 @草莓拉面不加冰 :同学你脑补有点厉害,首先没人逼你去学,其次学到应用层面也不用三年[无语],三个月就够了
【回复】需要统计学、linux、python/R语言、分子生物学、基因组学相关的知识
【回复】我本科也是中药学,硕士在南京大学做生物信息,现在在北京大学干湿结合,白血病方向,结合数据和实验发文章
OOHHOOooo:
log2那里根本不是为了正态化,是为了缩小值,加快运算速度,降低内存占用,同时也方便观察表达量相差巨大的两个基因的表达量变化

【回复】回复 @OOHHOOooo :关键你也没说对啊[笑哭] up说的让数据分布更趋于正态话也是对数转换的作用之一,你谈的也只是之一,有什么意义吗? 第二,你杠正太分布,你跟一个AI字幕杠个啥劲儿? 第三, 我说了fpkm是踩的坑,也没有说现在要拿fpkm来处理啊[doge]
【回复】讲给新手听的,有必要直接讲无量纲化吗[doge]
【回复】回复 @寻觅大于等待 :up不说我也不会指正,关键是我认为说错了,有必要指正
OOHHOOooo:
log2里加1也不是为了让所有数都是正数,而是避免转换最小值为0的数值时出现错误,实际上可以加1以外的任何正数,但是加1正好可以使最小值为0,所以大家逐渐都用加1了

杀我我有闪啊:
我只知道本科生、研究生,什么是自学生,离谱[doge]

最后の一枚:
[口罩]up做过生信数据库相关的么?求问下,谢谢

【回复】回复 @摸摸头哟- :[热]对…网页端的
【回复】回复 @最后の一枚 :网页端的?
【回复】回复 @寻觅大于等待 :[口罩][口罩]数据库构建。。建一个物种基因组数据库啥的
御坂机器人114514号:
临床大一 up好多视频我应该先学什么 课题也快开了 优先学r语言吗

WINDSON723:
我就是中药学的,研究生起开始学着做的生物信息学,先做的叶绿体基因组,毕设做的某属植物的差异表达分析(转录组),研究生阶段还做了某些菌类的全基因组。说实话,确实基本从头学,毫不相关。我是被逼着一点点做的。。说实话一直到硕士毕业,我分别学了linux,Python,Perl,都是刚刚入门的水平,以及一点点的R语言。只能说想学着做的话,必须得有一个负责任的好老师带着你一点点的弄,不然真的很难,非常的难,而且需要比在实验室里更多的精力和时间才能有一点点的进步。做生信真的太心累了,当然纯粹的个人感受。

【回复】我在学习生信的过程当中,更多的不是累,而是熬了很久终于跑出一张图的成就感!我觉得支撑你生信能够走下去长久的是需要一种热爱吧!
【回复】我是动物科学的,导师做基因测序什么的,但是并不是用软件的,好像主要是做实验的,想问下生信出来就业如何,待遇如何
太虚晓元:
学长,我也是兽医专业的,目前学生信无门可入,前来投靠

【回复】来吧![脱单doge][脱单doge][脱单doge]
不能包括特殊符号:
其实很多提出来的metric像log2,log2➕1,z score,FPKM,TPM。直观来讲,都是提出来一种让稳定数据,让数据在sample之前可比较的一些方法,还有矫正什么批次效应,其实背后的出发点很简单。

【回复】是的,所以明白背后的原理,让你操作更得心应手
飘逸的ty:
我刚开始logFC2000多 那火山图直接吓死我[笑哭]

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