预测蛋白质结构的AlphaFold，正在造福世界

controlism:
alphafold2刚放源代码我就开始下载数据库测试了。我们拿了5个未发表的结构，其中3个没有同源结构。3个是复合物2个是单体，预测结果单体看起来都不错，不过残基的二面角等参数在有些domain还是不太行。至于复合物可以说是全错，不管怎么换linker。现在alphafold2的结构例子都是ribbon形式，如果是atom形式的，就会发现还是有问题。不过至少可以预先知道做突变的位置在哪里，还是很有帮助的。但对于以后的冷冻电镜结构，如果是单体肯定要放上结构预测才能过审。实际使用上，如果有人显存不够，完全可以用cpu版的tensorflow，因为大概有1/3计算时间是在数据库里找同源结构。这次nature基本上就是没审就发了，因为science抢发了rosettafold，据别的组说效果远不如alphafold2。

【回复】现在AF2已经有支持多链的multimer和支持多构象的cluster了，比刚开源时强大非常多了。
【回复】AlphaFold2在很新的，做不太了MSA的序列上确实表现不好，得用ESMFold。esmfold的paper上有说这个问题
【回复】这个预测顶多减少工作量
苍桑的苍穹:
Ai能让人能成神，你们看[呲牙][打call][喜欢]

还以为要传火丶:
AlphaFold2在很新的，做不太了MSA的序列上确实表现不好，得用ESMFold。esmfold的paper上有说这个问题