用imageJ对马松染色结果进行定量

作者: I_am_Becky分类: 科学科普 发布时间: 2020-05-03 03:11:02 浏览:36098 次

用imageJ对马松染色结果进行定量

_Moonine:
我想问一下,我也看了好几个image的教程,就是最后出的这个area面积比,分母是系统默认整个照片的面积吗?如果我想要改分母区域的话应该怎么操作?拿up你这张片子举例就是想要蓝绿色区域比橙红色区域,不要那些空白部分的面积,该怎么操作呢?(非医学生,空白的是静脉血管之类的吗?得出面积比的时候包括这部分面积是合理的吗?)

【回复】回复 @天空魚_ : 试了一下,是胶原的蓝色面积占整张照片的比(我的是23%,area显示是609120),所以这个面积百分比直接用是不对的。要调一下threshold,选满组织,然后measure一下,出来一个全组织占整张照片的比(我的是43%,area显示是609120),用胶原的面积比除组织的面积比23%÷43%=53%,这个才是蓝色占红蓝的比值。
【回复】ImageJ的统计应该是按灰度值来算的,空白部分本身也不统计进去的。
云轩泠月:
加油楼主。制作的视频很赞。多张马松染色还可以通过编写image J的macro设定好threshold值或者采用自带的threshold功能进行批量识别和计算哦!

【回复】回复 @I_am_Becky :应该可以把图片的红绿蓝通道进行分离然后再转换为8-bit图像后再进行分析。然后在threshold之前应该也可以对图片做一些处理后再进行分析,这样样本间的误差应该会小一些。https://cloudstor.aarnet.edu.au/plus/s/ltVBT181ZpseNCo,这个网站我觉得up主你值得拥有。
【回复】回复 @云轩泠月 :文件下载了很久。请问一下分离颜色后如何减小样本间差距呢
【回复】soga 我的马松染色很不均一 有的片子颜色浅 有的深[喜极而泣]如果设定threshold一样的话就有差别了 不知道马松染色怎样能好看些
皮卡皮卡乒乒乓乓噗:
请问一下,我做出来的结果没有面积的比例,是均值,在哪里设置的吗?

【回复】视频上有,有个设置,可惜对测出来的数据加减项目
【回复】请问找到了吗?我也是均值,没有面积比例
阿方方12:
怎么选图片呢呜呜呜,全部选还是选蓝色区域多的

【回复】我是随机选10个视野,算出每个视野下照片的百分比值,再取平均值。(但是我感觉这样结果容易有偏差,救命)
【回复】回复 @之水于清 : 请问10个视野是个图片的图片本身的面积和放大倍数都是一样的吗
小鱼干必逃不了:
请问一下,几组图片对比、做统计学分析、需不需要调节的阈值一样呢?还是每张图片调到最适合的位置呢?

【回复】回复 @_Moonine : 请问是哪个视频有讲解呀?能问一下预调阈值是啥意思吗
【回复】回复 @_Moonine :是哪个视频呢
sasa邢:
我的面积比是0,大家知道如何解决这个问题嘛?

【回复】请问你有找到解决方法么
天才少女世界:
up主,我现在医学研究生研三,现在做的课题急需使用image j软件处理图片,有几个问题不太懂,想问几个关于image j的问题,你看到消息可以回复我一下吗15828002451,可以付费,万分感谢!!跪求。24小时在线!!

bzwjl:
请问如果我计算皮肤的胶原容积分数,分母应该是视野下的真皮组织面积,还是视野下整个皮肤组织?

【回复】回复 @别赞我谢谢 : 您好,请问蹲到了吗,能不能加俺一个,我也在做这类课题
【回复】我也做类似课题,可以一起探讨吗
一只年年鱼:
请问这个算出来的area面积单位是像素吧,不是平方um

【回复】可以设定单位 set scale 几个像素是 1um 就可以换算了
蒂薇薇薇:
请问分析的时候是用哪个数值呀?%Area吗

horseflyyyyying:
为什么我的是红色的被标记出来了,蓝色的反而没有,我还得调整两个拖动条才能改变,视频中师姐怎么没动就可以啊

【回复】我也是[酸了]请问你解决了嘛

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